Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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