Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM2Q13029 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms