Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
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