Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB40BQ12829 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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