Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF5Q12774 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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