Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms