Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms