Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms