Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LTBQ06643 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTBQ06643 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTBQ06643 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms