Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms