Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCNT1Q02742 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms