Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC013452.2-201ENST00000557910 743 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC011773.4-201ENST00000562577 487 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL355922.2-201ENST00000557335 1398 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LECT2-201ENST00000274507 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AP004833.1-201ENST00000507987 1238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms