Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms