Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms