Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDM2Q00987 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms