Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms