Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms