Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms