Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms