Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKAA2P54646 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms