Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms