Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUFMP49411 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUFMP49411 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUFMP49411 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUFMP49411 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms