Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD2P49005 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD2P49005 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD2P49005 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD2P49005 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms