Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA4P48058 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms