Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms