Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCR1P46094 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCR1P46094 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCR1P46094 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms