Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPOP42166 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPOP42166 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPOP42166 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPOP42166 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms