Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK1P39086 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK1P39086 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms