Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms