Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms