Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms