Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN6P29350 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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