Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD10P28358 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms