Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms