Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRHP20396 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRHP20396 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRHP20396 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRHP20396 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms