Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL2P19875 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL2P19875 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms