Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH1P12830 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms