Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms