Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB1P08034 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJB1P08034 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms