Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPBP07199 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms