Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms