Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms