Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms