Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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