Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNMO15061 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms