Protein–RNA interactions for Protein: O00623

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX12O00623 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX12O00623 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX12O00623 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX12O00623 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX12O00623 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX12O00623 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX12O00623 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX12O00623 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX12O00623 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX12O00623 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX12O00623 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms