Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms