Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA5E9PKD4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms