Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVV-2B6SEH9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms