Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ISM1B1AKI9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms